پزشکی پیشگیری تغذیه خواص گیاهان دسته‌بندی نشده روان شناختی زیبایی ورزش

محققان از ژنومیک برای بازسازی شیوع تب زرد در سائو پائولو استفاده می کنند

محققان از ژنومیک برای بازسازی شیوع تب زرد در سائو پائولو استفاده می کنند

سه موج بیماری بین سال های 2016 و 2018 این کشور را در برگرفته است. یک گروه بین المللی از محققان نحوه انتشار ویروس را در یک مطالعه منتشر شده در PLOS عوامل بیماری زا بر اساس توالی 51 جدایه ویروسی استخراج شده از پشه ها و میمون ها. اعتبار: ادواردو سزار / Pesquisa FAPESP

ویروس تب زرد به طور معمول محدود به منطقه آمازون است ، اما این ویروس بین سال های 2016 و 2018 در جنوب شرقی برزیل منتشر شده و باعث بدترین شیوع اپیدمی و اپیزوتیک در دهه های گذشته در آنجا شده است. وزارت بهداشت 2،251 مورد تب زرد در انسان و 1،567 مورد در میمون در برزیل را از دسامبر 2016 تا ژوئن 2019 تأیید کرد.

طبق مطالعه ای که در ژورنال منتشر شده است PLOS عوامل بیماری زا، سه موج اپیدمی / اپیزوتیک که در این دوره در ایالت سائوپائولو ، پرجمعیت ترین منطقه در جنوب شرقی رخ داده است ، به دلیل دودمان مختلف ویروس ایجاد شده است. در موج اول (ژوئیه 2016 – ژانویه 2017) ، ویروس از شمال وارد این ایالت شد و احتمالاً از ایالت همسایه میناس جرایس (Minas Gerais) آمده و عمدتا در شهرهایی مانند سائو خوزه دو ریو پرتو و ریبرایو پرتو گسترش یافت. موج دوم (فوریه-ژوئن 2017) شدیدتر بود و منطقه را از مرز Minas Gerais در Poços de Caldas تا کامپیناس شستشو داد. بیشترین تعداد موارد در موج سوم (جولای 2017 – فوریه 2018) اعلام شده است. این ویروس پس از رسیدن به شهر سائو پائولو ، به جنوب در منطقه دره ریبیرا گسترش یافت ، جایی که شهرهای پرجمعیتی را با نرخ پوشش واکسیناسیون پایین یافت و به یک مشکل بزرگ بهداشت عمومی تبدیل شد.

این یافته ها که توسط یک گروه بین المللی از محققان تحت حمایت FAPESP در ژورنال گزارش شده است ، بر اساس تجزیه و تحلیل ژنومی 51 جدایه ویروسی استخراج شده هم از پشه های جمع آوری شده در مناطق آسیب دیده و هم از میمون های تلف شده از این بیماری است. این مواد توسط مرکز نظارت بر اپیدمیولوژیک (CVE) – آژانس وزارت بهداشت ایالت سائو پائولو – به موسسه آدولفو لوتز (IAL) ، آزمایشگاه مرکزی بهداشت عمومی در سائو پائولو ارسال شده است.

“بر اساس توزیع جغرافیایی و زمانی موارد در پستانداران غیر انسانی ، در تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک [studying the mutations in the viral genome that lead to the emergence of novel lineages] و در تجزیه و تحلیل گیاه شناسی [studying the processes that determined the geographical distribution of the different lineages]، می توان مشخص کرد که وقتی ویروس وارد ایالت سائوپائولو می شود ، با چه سرعتی و از چه راهی گسترش می یابد ، و همه جنبه های گردش آن چیست “،” Renato de Souza ، محقق در IAL و یکی از نویسندگان اصلی مقاله ، به Agência FAPESP گفت.

سوزا توضیح داد ، این سطح از جزئیات در توصیف اپیدمی فقط به لطف استفاده از فناوری تعیین توالی ژنتیکی MINION امکان پذیر است. این پلتفرم قابل حمل ، سریع و ارزان است و امکان نظارت در موارد واقعی در محلی را که در آن اتفاق می افتد ، فراهم می کند.

این استراتژی برای اولین بار در سال 2016 در برزیل برای ردیابی حرکت ویروس zika در قاره آمریکا استفاده شد. اخیراً به محققان مرکز کشف ، تشخیص ، ژنومیک و اپیدمیولوژی (CADDE) برزیل و انگلیس کمک کرده است تا روند COVID-19 در برزیل را ردیابی کنند. این پروژه توسط استر سابینو ، محقق دانشگاه سائوپائولو و نونو فاریا در دانشگاه آکسفورد انگلیس هدایت می شود و توسط FAPESP ، شورای تحقیقات پزشکی انگلستان و صندوق نیوتن پشتیبانی می شود.

میزبان تصادفی

ویروس تب زرد به طور دائمی در منطقه آمازون گردش می کند و گهگاه شرایط مطلوبی را فراهم می کند که باعث فرار آن می شود. سوزا توضیح داد که برای این اتفاق ، جمعیتی از پشه های ناقل باید با جمعیتی از نخستیان وحشی که به اندازه کافی متراکم هستند و می توانند زنجیره انتقال را برای مدتی حفظ کنند ، در تماس باشند.

وی گفت: “این گسترش دائمی نیست.” “ویروس سرانجام ظرفیت گردش در محیط مورد نظر را از دست می دهد و تنها در صورت ورود مجدد به آن برمی گردد. بین سالهای 2016 و 2018 ، منطقه گردش خون تا حد بی سابقه ای گسترش یافت. شرایط گسترش ویروس درست بود. این باعث آلودگی پستانداران وحشی در Serra da Mantiqueira [forest area of the state of São Paulo] و به منطقه ای در نزدیکی پارک بزرگ جانورشناسی در حومه شهر سائو پائولو رسید. این ممکن است طی چند سال ، هر زمان که رشد کافی جمعیت پستانداران در این مکان ها وجود داشته باشد ، دوباره تکرار شود. “

سوزا گفت ، از نظر اپیدمیولوژی ، در این دوره شیوع تب زرد سیلواتیک وجود دارد. اگرچه موارد زیادی در بین انسان ها وجود داشت ، انتقال فقط در خارج از محیط شهری از طریق پشه های درختان مانند Haemagogus و Sabethes اتفاق افتاد.

وی گفت: “در این حالت ، قرار گرفتن در معرض انسان تصادفی بود. رشد نفوذ انسان در محیط های طبیعی و جنگل ها یکی از عوامل موثر در این امر بود” ، وی با بیان اینکه اگر یک زنجیره انتقال شهری از طریق Aedes aegypti ایجاد شده بود ، احتمال بروز این بیماری وجود داشت. بسیار بیشتر بوده است ، و به همان میزان در شیوع بیماری دنگی رسیده است.

وی گفت: “مسئله این است كه ساختار انتقال سیلواتیک هرچه نزدیك تر به مناطق شهری نزدیك می شود ، خطر ورود ویروس به بافت شهری را افزایش می دهد.”

پیگیری گردش پاتوژن در جمعیت میمون ها یک استراتژی نظارت اپیدمیولوژیک موثر در نظر گرفته شده است ، زیرا شناسایی زود هنگام مناطق پر خطر و برنامه ریزی استراتژی های کنترل مانند کمپین های واکسیناسیون را تسهیل می کند.

“یک استراتژی نظارت فقط مبتنی بر نظارت بر موارد در انسان ، تنها 20٪ از افراد آلوده را تشخیص می دهد ، که این نسبت علائم است ، به طوری که گزارش کمبود همیشه مهم خواهد بود. در میان میمون ها ، گونه هایی وجود دارد که 90٪ در آنها علائم ایجاد می کنند و سوزا گفت: با نظارت بر این حیوانات ، بیماری در حال گسترش ویروس و به موقع اجرای برنامه های مبارزه است.


ویروس تب زرد مسئول اپیدمی کنونی در برزیل از سال 1980 در آمازون سرچشمه گرفت


اطلاعات بیشتر:
سارا سی هیل و همکاران ، نظارت ژنومیک ویروس تب زرد در سائو پائولو ، برزیل ، 2016 – 2018 ، PLOS عوامل بیماری زا (2020) DOI: 10.1371 / journal.ppat.1008699

استناد: محققان از ژنومیک برای بازسازی شیوع تب زرد در سائو پائولو استفاده می کنند (2020 ، 5 نوامبر) در 5 نوامبر 2020 از https://medicalxpress.com/news/2020-11-genomics-reconstitute-yellow-fever-outbreak.html بازیابی شده است.

این برگه یا سند یا نوشته تحت پوشش قانون کپی رایت است. جدا از هرگونه معامله عادلانه با هدف مطالعه خصوصی یا تحقیق ، هیچ بخشی بدون اجازه کتبی قابل تولید نیست. محتوای مذکور فقط به هدف اطلاع رسانی ایجاد شده است.